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　　辣椒種上攜帶的病毒不能像消滅其他病菌那樣被殺死，只能通過一定的藥物處理后，使其失去發病的能力。根據辣椒病毒對堿性藥物比較敏感，容易被堿性藥物所鈍化的特點，目前主要使用堿性藥物來浸泡種子。常用的消毒堿液有100倍的高錳酸鉀藥液、10倍的磷酸三鈉藥液、100倍的氫氧化鈉藥液等。浸種時，先用溫水把種子泡濕，然后再用上述藥液浸種20-30分鐘。浸種結束后，用清水把種子上的殘留堿液清洗干凈。

　　為了殺死辣椒種子表皮病菌及鈍化病毒，以達到減輕病害發生的目的，在種子浸種催芽前最好進行種子滅菌消毒。可采取以下方法：

　　種子放入50℃-55℃熱水中，恒溫浸種15-20分鐘，并不斷地攪動，待水溫下降時加入熱水，使水溫保持在50℃-55℃之間，20分鐘后加入冷水降到20℃-30℃。

　　用10%磷酸三鈉溶液浸泡20分鐘后用清水沖洗干凈，種子消毒后，放入25℃左右水中。之后，在室溫下浸泡12小時左右，然后進行浸種催芽。

　　辣椒浸種催芽方法：辣椒種子吸足水分后，用紗布包上，用肥皂搓洗后用清水沖洗干凈，瀝干水分，或用洗衣機甩干桶甩1分鐘，放在瓦盆等容器內，種子上下都要鋪蓋擰干的濕毛巾，放在火炕或溫室煙道上催芽，有條件的可放在恒溫箱內催芽更好。催芽的適宜溫度為28℃-30℃。為使種子受熱均勻，每天要上下翻動兩次，上下鋪蓋的毛巾一定要保持濕潤，而且通透性要好。未出芽前，每天要投洗1-2次。經4-5天后出芽可達70%左右，待芽長1毫米時，可擇日播種。