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絲瓜留種田需要500-1000米的隔離區。一般生產者選留絲瓜種子，株選效果很好。選留種子時，選擇具有本品種性的植株。一般要求節間短、節間均勻、葉片大小適中、葉柄短、結瓜早、絲瓜條上下粗細均勻的植株留作種株，在中期人工受粉后套袋，防止雜交。套袋的方法：在雌花開放時，用自花的雄蕊對花后，套上小紙袋，花冠萎縮后就可去掉，把種瓜作好記號，不要誤采。一般每株可留種瓜3-4條。
瓜種采收時間最好在植株自然枯死后采瓜剖種，種子曬干后收藏。采種后的絲瓜絡可以入藥，也可做廚房清潔抹布，或送去專業加工工廠生產防汗鞋墊的夾層，經濟收入也比較可觀。
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