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病毒病為菜心的主要病害，主要由煙草花葉病毒和黃瓜花葉病毒侵染引起，傳染媒介主要是蚜蟲。主要在幼苗期發生，因品種或毒源不同，染病后常出現兩種癥狀，一種為畸形花葉型，另一種為壞死斑點型。植株染病后結莢少，種子不實率多，發芽率低。
針對病毒病的防治只能采取綜合性的農業措施，以預防為主。選用抗病品種，一般早熟品種比遲熟品種抗病性能強。播前清除前作殘株和雜草，避免連作，及時拔除病株燒毀或深埋，手接觸病株后要及時消毒，防止人為傳病。定期對田間噴施護樹大將軍消毒殺菌，減少病菌滋生。注重培育壯苗，施足基肥，加強肥水管理，增施磷鉀肥，培育健壯植株，高溫干旱季節勤澆水，可減輕發病程度。控蚜防病，苗期覆蓋銀灰色遮陽網或懸掛銀灰色薄膜條驅蚜或利用黃板誘殺蚜蟲，并注意及時用藥防治蚜蟲。發病初期選用護樹大將軍+植物細胞免疫因子以寄主植物抗病機理及利用病菌毒性變異原理，控制植物生理性病害和侵染性病害繁衍。
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