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選擇抗病品種，花椰菜播種前使用50℃左右的溫水進行浸種，以減少田間黑腐病侵染源。并用新高脂膜拌種后即可下種，可隔離病毒感染，提高花椰菜出苗率。
適時播種，幼苗出土后要經常查看苗情，發現病苗、弱苗等及時拔除，以保證田間幼苗生長健壯，減少病菌侵染率。植株生長期間要追肥水2～3次，防止植株早衰，增強其抗病性。田間灌水謹防大水漫灌，以減少病菌傳播蔓延的機會。
田間耕作盡量避免造成植株人為傷口，減少病菌侵染途徑。發現感染黑腐病植株，及時噴藥防治，可使用針對性藥劑加新高脂膜混合使用，以改造高毒農藥為中毒，中毒農藥為低毒，低毒農藥為微毒。降低每畝用藥量，多倍提高防治效果。
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