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根系由乳白色變成紅褐色，不發新根，停止生長，植株生長緩慢，幼苗萎蔫。主要是由床土溫度低、濕度大所致。在連陰雨天的環境條件下更容易發生爛根。另外，連作地塊也易引發西瓜爛根。
預防措施：改善育苗的環境條件，在早春最好采用電熱溫床或生物釀熱溫床育苗；控制澆水，尤其是陰雨天不澆水；對爛根較輕的瓜苗，可通過苗床松土，撒施草木灰等方法增溫、降濕，以利于瓜苗盡快復壯生長；在瓜苗發出新根后，澆施4000倍的802與100倍的尿素混合液，促進西瓜根系生長發育。
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