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　　微生物肥料是以微生物的生命活動促使作物得到特定肥料效應的一種制品，是農業(yè)生產中使用肥料的一種。
　　首先，微生物肥料與富含氮、磷、鉀的化學肥料不同，微生物肥料是通過微生物的生命活動直接或間接地促進作物生長，抗病蟲害，改善作物品質，而不僅僅以增加作物的產量為惟一衡量標準。另一方面，從目前的研究和試驗結果來看，微生物肥料不能完全取代化肥，比如用根瘤菌菌劑接種花生。大豆等豆科植物或牧草可以提高共生固氮效能，增產效果很明顯。但在同樣有效產量構成的情況下，只能不同程度減少化肥的使用量而不能完全取代。除此以外，每一種肥料都有其適用作物和地區(qū)，目前還沒有一種肥料可以用到哪里哪里靈。因此，從微生物的種類及其功能來看，與傳統(tǒng)的化肥和有機肥又有著本質的區(qū)別。
　　從微生物肥料的功能不同可將其分為二類。
　　一、微生物拌種劑
　　利用多孔的物質作為吸附劑(如草炭、蛭石)，吸附菌體的發(fā)酵液而成菌劑，這種菌劑用于拌種或蘸根。有益微生物通過其生命活動增加植物營養(yǎng)元素的供應，改善植物營養(yǎng)狀況而增產。其代表品種為各類根瘤菌肥料，主要應用于豆科植物，使其能在豆科植物根、莖上形成根瘤，同化空氣中的氮素來供應植物氮素營養(yǎng)。
　　也可將兩種或兩種以上微生物(固氮菌、芽孢菌或其它一些細菌)互不拮抗、互相有利，通過其生命活動使作物增產，其作用不僅提高營養(yǎng)元素的供應水平，還包括菌在繁殖過程中自身產生的各類植物生長刺激素，拮抗某些病原菌，達到抑制病害的目的，尤其是土傳病害，例如線蟲病害、全蝕病、青枯病、枯萎病等。有的菌劑能活化土壤中被固定的磷、鉀礦物，使之被植物吸收。另一些菌劑能加速作物秸稈的腐熟和促進有機廢物發(fā)酵。
　　二、復合微生物肥料
　　除了含有效微生物外，還有一些營養(yǎng)物質。根據(jù)營養(yǎng)物質的不同可分為：微生物和有機物復合；微生物和有機物質及無機元素復合。如果根據(jù)作用機理則可分為：以營養(yǎng)為主；以抗病為主，以降解農藥為主；也可多種作用同時兼有。每種肥料各有特色，作用不完全一致，但目的都是為了提高作物的產量，減少化肥用量，降低成本，改良土壤和改善作物品質，保護生態(tài)環(huán)境。
　　如果按其制品中特定的微生物種類，可分為細菌肥料(根瘤菌肥、固氮、解磷、解鉀肥)、放線菌肥(抗生肥料)、真菌類肥料(菌根真菌、霉菌肥料、酵母肥料)、光合細菌肥料。
　　如果按作用機理，可分為根瘤菌肥料、固氮菌肥料(自生或聯(lián)合共生類)、解磷肥料、硅酸鹽類肥料、芽孢桿菌制劑、分解作物秸稈制劑、微生物植物生長調節(jié)劑類。目前正處于研究與探索的促進植物生長調節(jié)劑類。