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西瓜催芽的一般做法是:把浸種后的濕種子裝入一布袋內，用力掄幾下，去掉種子上多于的水，也可以先把濕種子攤開晾至種皮不濕漉漉后再裝入濕布袋內。把種子袋放入催芽箱內或放入一盆內，把盆放到火爐旁或者火炕上，上面覆蓋棉被保濕，進行適溫催芽。
催芽適溫為25到32攝氏度。為防種子失水過快，催芽期間，種袋上應加蓋幾層濕布濕布擰干水后再蓋上，否則滴水過多易引起爛種。還可以把種袋用一塑料袋裝好但不扎口，把種袋放入貼身的內衣口袋內，借提溫進行催芽。催芽期間，每隔12小時左右，要把種子袋投入溫水中輕輕搓洗幾遍，洗去種子上表面的黏液，之后輪甩種袋或倒出種子攤開晾一會兒，待種子表面不水漉漉后再繼續催芽。
無籽西瓜進行種子催芽處理時，催芽期間的溫度應適當高一些，以30到32攝氏度為宜。
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