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大豆菌核病多從植株主莖中下部分枝處開始發病，病斑水漬狀，不規則形，淺褐色或近白色，可環繞莖部并向上下蔓延，病部以上往往枯死，也可造成莖稈折斷，潮濕時病部生絮狀白色菌絲，其上產生黑色鼠糞狀菌核，病莖髓部變空，菌核占其空間。后期干燥時莖部皮層縱向撕裂。葉片被害時呈暗青色水漬狀，腐爛，有時有絮狀菌絲。
防治方法：
1、病區必須避免大豆連作或與向日葵、油菜輪作或鄰作。與禾本科作物輪作一年以上即有明顯效果。
2、病田收獲后應深翻，將表土層的菌核翻入土中；及時清除或燒毀殘莖以減少菌源。大豆封垅前及時中耕培土，防止菌核萌芽出土或形成子囊盤。注意排淤治澇，平整土地，防止積水和水流傳播。
3、汰除種子中混雜的菌核。
4、菌核萌發出土后至子囊盤形成盛期，于土表噴灑50％速克靈可濕性粉劑，每畝約30克～60克，加水40公斤～50公斤噴霧?；蛴?0％多菌靈可濕性粉劑每畝100克或30％菌核利可濕性粉劑50克，加水50公斤也有良好效果，但在發病后噴灑植株表面效果較差。
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