水稻旱育秧苗床雖不易爛秧，但最易發生立枯病死苗，輕者20%－30%，重者50%以上，采取以下措施，可以有效地防治立枯病。
　　１、對土壤進行調酸處理：中性和堿性土壤，在播種前要進行調酸處理，把pH值調至6以下，可以有效地控制立枯病的浸染為害。具體做法是：在播種前對土壤進行測試，pH值為6－6.5的，每平方米施用專用調酸肥30－40g，pH值為6.5－7的施40－50g，于播種前一天施入，并與土壤充分混合，使土壤pH值調至4.5－5.5之間。
　　２、對苗床土壤消毒，避免土壤傳病：經過調酸處理后苗床，每平方米用70%的敵克松2g，稀釋成600倍水溶液，均勻地噴灑在苗床上，如遇晴天，敵克松用量減半，否則會燒種。
　　３、播種不要過密，以免產生弱苗：掌握播種量，是培育旱育秧壯苗的關鍵一環。一般育50－55天大苗秧，每平方米播種量為20－25g。如播種過密，秧苗瘦長，抗性減弱，易感立枯病，而壯苗則抗性較強，不易感染立枯病。
　　４、藥劑防治：1葉1心至2葉1心期，最易發生立枯病浸染死苗，可用敵克松600倍液或立枯靈500倍液進行葉面噴霧，隔5－7天再噴1次，連噴2次，特別是敵克松對防治立枯病有特效。
　　５、克服低溫，以免誘發立枯病：早稻播種至出苗以保溫為主，膜內溫度保持在30－32℃；1葉1心時以控溫控濕為主，膜內溫度保持在25℃；2葉1心時，晴天上午10時至下午4時半開膜，陰天中午開膜1－2小時，雨天打開膜換氣，但膜內溫度不能低于12℃，否則易誘發立枯病，到3葉1心時揭膜。