藥物引起的腹瀉多維用量過大時會引起鴨腹瀉，要及時調整用量；對藥物中毒引起的腹瀉要保肝護腎，通腎利尿；對連續用藥引起的腹瀉，要調整腸道菌群，加入芽孢桿菌和益生素，同時配合使用抗生素防止繼發感染。在用藥過程中，要由低敏到高敏，由單一用藥到用復方制劑，制定合理的用藥程序，選用信譽好的廠家生產的獸藥。飼料引起的腹瀉飼料保存不當易引起霉變，鴨吃了霉變的飼料就會發生腹瀉。可在飼料中加入脫霉劑（制霉菌素、克霉唑等）進行預防；飼料中蛋白質過高，會加重鴨腎臟的負擔，引起代謝紊亂，出現腹瀉，治療須及時通腎；鈣、磷比例不當和維生素缺乏時也會引起鴨腹瀉，要及時調整飼料配方。環境引起的腹瀉夏季，由于高溫天氣使鴨飲水量加大導致腸道菌群減少、陰雨雷電的應激、飼養密度過大、通風不暢、防暑降溫不良、室內氨味過大等都會引起鴨腹瀉，所以在高溫天氣要做好鴨群的飼養管理，及時清糞，更換墊料，供給新鮮清潔飲水，同時需在其飼料中加入魚肝油、維生素C等以減少應激。疾病引起的腹瀉細菌性疾病引起的腹瀉有大腸桿菌病、漿膜炎、魏氏梭菌病等。治療大腸桿菌病、白痢可選用氨芐西林、頭孢拉啶、環丙沙星等；治療漿膜炎和魏氏梭菌病，可選用利福平、磺胺二甲氧嘧啶、氟苯尼考等藥物；對病毒性疾病如鴨流感、副黏病毒病要從預防入手，7日齡時接種禽流感油苗，14日齡接種新城疫疫苗。