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　　進入21世紀以來，隨著耕作制度多元化、栽培方式多種化、品種布局復雜化、農田生態多樣化、冬季氣候趨暖化，南方部分水稻產區不斷擴散水稻黑條矮縮病，受害主要作物為單季雜交稻和雜交晚稻。目前在我省發生危害的水稻黑條矮縮病，其病毒是水稻黑條矮縮病毒和南方水稻黑條矮縮病毒，前者是以灰飛虱永久性傳毒（一旦獲毒，終身傳毒，但不會經卵傳毒），后者是以“灰飛虱＋白背飛虱，白背飛虱為主”傳毒。種子不會傳毒。
　　該病害開始零星發生，隨著毒源的積累、傳毒介體數量的增加，呈突然爆發的趨勢。一般發病田塊損失產量10%-20%，重者損失30%-80%，甚至絕產絕收，成為雜交水稻的災發性病害，給水稻生產帶來嚴重威脅。
　　雜交水稻黑條矮縮病的共同特征是：病株明顯矮縮，分糵增多，葉色濃綠，葉片僵直，新葉有的出現扭曲皺縮。但在秧苗期、分糵期和抽穗期的癥狀表現各有特點。由于其發病癥狀、流行程度較上世紀60年代初發期有較大差異，故常被誤診為種子質量問題或除草劑藥害，事實上它們是有區別的。
　　秧苗期癥狀：病株顏色深綠，心葉抽生緩慢，心葉葉片短小而僵直，葉枕間距縮短，其葉鞘被包裹在下葉鞘里，植株矮小，不能抽穗。而由除草劑引起藥害的癥狀是枯黃；由植物生長調節劑引起藥害的癥狀是扭曲；由雜交稻種性不純引起的雜株在秧苗期一般看不出來。
　　分糵期癥狀：病株分糵增多叢生，上部數片葉的葉枕重疊，心葉破下葉葉鞘而出或從下葉枕口呈螺旋狀伸出，葉片短而僵直，葉尖略有扭曲畸形。植株矮小，主莖及早生分糵尚能抽穗，但穗頭難以結實，或包穗，或穗小，似侏儒病。而處于分糵期的藥害植株，其所在葉片均葉形直立，心葉扭曲畸形，邊緣白化；雜交稻種性不純的雜株則生長比較正常，一般株形矮小。
　　抽穗期癥狀：全株矮縮叢生，有的能抽穗，但相對抽穗遲而小，半包在葉鞘里，劍葉短小僵直；在中上部葉片基部可見縱向皺褶；在莖稈下部節間和節上可見蠟白色或黑褐色隆起的短條脈腫；在感病的粳糯稻莖稈上可見白蠟狀突起的脈腫斑。這是當前黑條矮縮病的最突出表現癥狀。