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　　外部形態鑒定

　　定義及分類：根據玉米品種的種子、幼苗和植株外部形態的差異鑒定品種，分為種子形態鑒定法、幼苗形態鑒定法和田間種植鑒定法等。

　　種子形態鑒定法特點：簡單、方便、快速，在傳統農業生產中應用普遍，但可供鑒定的種子性狀少且易受種子成熟度、種子生產生態環境和種子貯藏等條件影響，鑒定結果具有一定的主觀性。品種間種子形態差異越來越小，鑒定形態差異來辨別種子越來越困難，準確性也越來越低。

　　幼苗形態鑒定法特點：所需試驗設備及操作簡易、成本低，但能用于品種鑒定的幼苗特異性狀較少，所以只能用于有明顯差異品種間的鑒定。

　　田間種植鑒定法特點：具有合法性、科學性、準確性等優點，是進行品種真實性鑒定結論判定的最終方法，但周期性長、時效性差、工作量大，不能滿足現代農業生產及種子貿易中快速鑒定的要求。

　　蛋白質指紋圖譜法

　　定義與分類：利用電泳技術對待檢測樣品的種子或幼苗的蛋白質進行分離、染色，形成蛋白質電泳圖譜，與標準樣品進行比較，來鑒定品種。包括同工酶電泳、種子貯藏蛋白電泳法等。

　　同工酶電泳法特點：目前，已有30多種同工酶用在作物品種鑒定中，最常用的是脂酶同工酶和過氧化物同工酶等。同工酶電泳雖然比形態鑒定更加快速，但同工酶具有植物組織及器官特異性，受個體發育及生態環境的影響，且一些種類的同工酶在提取和分離過程中容易失去活性。

　　種子貯藏蛋白電泳法特點：在品種鑒定上應用較多的是醇溶蛋白（和谷類）和球蛋白（豆類）。該方法直接從種子中提取蛋白質，操作技術簡單，結果相對穩定，但是隨著近親品種的不斷涌現，尋找品種鑒定用的特異蛋白的難度增大。

　　DNA指紋圖譜法

　　定義與分類：學名為DNA分子標記鑒定法，通常也稱為DNA指紋圖譜法，種類較多，當前在農業行業標準中常用的方法為簡單重復序列（SSR）標記法。

　　SSR標記法通常是指以2個——5個核苷酸為單位串聯重復不同次數形成簡單重復序列，在不同品種的基因組DNA中簡單重復序列的重復次數有差異，這種差異可以通過聚合酶鏈反應（PCR）擴增及電泳法進行檢測，從而能夠區分不同品種。

　　SSR標記法特點：SSR標記廣泛、隨機、均勻的分布在基因組中，可以提供整個基因組的遺傳信息，參與遺傳物質結構的改變、基因調控等過程，能夠直接反應品種遺傳物質在DNA水平上的差異。具有準確性高、多態性高、檢測重復性好、操作簡便、經濟、不受季節和環境影響等特點。以SSR標記法為主，形態鑒定方法為輔，能夠更高效、更準確進行品種鑒定。